Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms