Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms