Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms