Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHM5

KDM2B, Lysine-specific demethylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2BQ8NHM5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms