Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms