Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms