Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms