Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIN2CQ14957 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms