Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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