Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms