Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms