Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms