Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A1P19634 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms