Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL2P13500 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL2P13500 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms