Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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