Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms