Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms