Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCF3Q9NUQ8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCF3Q9NUQ8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms