Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms