Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms