Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms