Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms