Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWA5B2Q8N398 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms