Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLNKQ7Z7G1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLNKQ7Z7G1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms