Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC2DQ5SRD0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms