Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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