Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASIC2Q16515 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ASIC2Q16515 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms