Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSME4Q14997 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms