Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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