Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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