Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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