Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IKZF1Q13422 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IKZF1Q13422 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IKZF1Q13422 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IKZF1Q13422 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IKZF1Q13422 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms