Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.497e-8■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 DENND4C-204ENST00000380437 5963 ntTSL 54.28□□□□□ -1.727e-8■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 DENND4C-206ENST00000494124 5335 ntTSL 1 (best)3.99□□□□□ -1.777e-8■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 DIAPH1-213ENST00000523100 1180 ntTSL 523.67■■□□□ 1.383e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.641e-9■□□□□ 11
ILF3Q12906 CSK-213ENST00000569462 534 ntTSL 418.7■□□□□ 0.583e-18■□□□□ 11
ILF3Q12906 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.331e-9■□□□□ 11
ILF3Q12906 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.331e-9■□□□□ 11
ILF3Q12906 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.331e-9■□□□□ 11
ILF3Q12906 PIP5K1C-206ENST00000592530 456 ntTSL 516.05■□□□□ 0.163e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.071e-10■□□□□ 11
ILF3Q12906 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.61e-10■□□□□ 11
ILF3Q12906 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.831e-9■□□□□ 11
ILF3Q12906 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-7■□□□□ 11
ILF3Q12906 ATIC-207ENST00000443953 2187 ntTSL 219.36■□□□□ 0.698e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 ATIC-204ENST00000427397 1046 ntTSL 518.6■□□□□ 0.578e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.458e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 PHKA2-204ENST00000469645 728 ntTSL 517.73■□□□□ 0.438e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.138e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 ATIC-208ENST00000444305 569 ntTSL 415.52■□□□□ 0.088e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 PHKA2-206ENST00000473739 751 ntTSL 313.62□□□□□ -0.238e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 AC092279.1-201ENST00000594934 1864 ntTSL 211.78□□□□□ -0.528e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.558e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.598e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.598e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 AC092279.1-202ENST00000597683 1966 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.68e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 ATIC-214ENST00000488712 744 ntTSL 310.27□□□□□ -0.778e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 EIF3L-210ENST00000464790 583 ntTSL 310.16□□□□□ -0.788e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.818e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 ATIC-202ENST00000413174 695 ntTSL 58.58□□□□□ -1.048e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.428e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 MNAT1-209ENST00000557134 680 ntTSL 34.65□□□□□ -1.678e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 MNAT1-204ENST00000554002 616 ntTSL 33.11□□□□□ -1.918e-8■□□□□ 11
ILF3Q12906 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.066e-22■□□□□ 11
ILF3Q12906 MDM2-214ENST00000400501 406 ntTSL 24.36□□□□□ -1.715e-10■□□□□ 11
ILF3Q12906 ARHGEF1-207ENST00000594258 919 ntTSL 319.59■□□□□ 0.733e-9■□□□□ 11
ILF3Q12906 ARHGEF1-213ENST00000595897 2973 ntTSL 1 (best)15.96■□□□□ 0.143e-9■□□□□ 11
ILF3Q12906 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.971e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.091e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.622e-7■□□□□ 11
ILF3Q12906 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.22e-7■□□□□ 11
ILF3Q12906 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-7■□□□□ 11
ILF3Q12906 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-7■□□□□ 11
ILF3Q12906 SLC1A5-204ENST00000593713 774 ntTSL 311.04□□□□□ -0.642e-7■□□□□ 11
ILF3Q12906 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.567e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 CRYZL1-204ENST00000381554 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.697e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 AP000311.1-201ENST00000429238 1078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.897e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 CRYZL1-201ENST00000290244 1685 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.917e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.317e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 CRYZL1-218ENST00000452420 1556 ntTSL 26.21□□□□□ -1.427e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 CRYZL1-216ENST00000441940 535 ntTSL 56.01□□□□□ -1.457e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 CRYZL1-213ENST00000437996 595 ntTSL 34.31□□□□□ -1.727e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 CRYZL1-221ENST00000480893 656 ntTSL 24.06□□□□□ -1.767e-6■□□□□ 11
ILF3Q12906 OSGEP-203ENST00000553640 578 ntTSL 318.17■□□□□ 0.55e-10■□□□□ 11
ILF3Q12906 OSGEP-205ENST00000554699 762 ntTSL 317.82■□□□□ 0.445e-10■□□□□ 11
ILF3Q12906 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.155e-10■□□□□ 11
ILF3Q12906 OSGEP-207ENST00000555223 773 ntTSL 514.39□□□□□ -0.115e-10■□□□□ 11
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ILF3Q12906 MDM2-227ENST00000540709 502 ntTSL 33.65□□□□□ -1.835e-8■□□□□ 10.9
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ILF3Q12906 DROSHA-207ENST00000507438 860 ntTSL 49.88□□□□□ -0.833e-13■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.873e-13■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.043e-13■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.513e-13■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.921e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.881e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 SDCCAG3-203ENST00000371723 865 ntTSL 225.75■■□□□ 1.713e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.511e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.973e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.533e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.493e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.463e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 C16orf70-211ENST00000569914 768 ntTSL 317.63■□□□□ 0.417e-12■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 SDCCAG3-206ENST00000446833 459 ntTSL 317.2■□□□□ 0.343e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.23e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.163e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.413e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 GPX2-202ENST00000553522 1134 ntTSL 1 (best)10.58□□□□□ -0.723e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 GPX2-205ENST00000612794 1084 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.173e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 CAMKMT-206ENST00000428993 526 ntTSL 35.96□□□□□ -1.463e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 CFI-207ENST00000618244 1345 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.123e-8■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.273e-8■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.343e-8■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.383e-8■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.643e-8■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 PUS7-204ENST00000481939 2436 ntTSL 516.44■□□□□ 0.221e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.25e-7■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 RPS10-203ENST00000464218 615 ntTSL 512.39□□□□□ -0.435e-7■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 RPS10-206ENST00000494077 781 ntTSL 211.63□□□□□ -0.555e-7■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 RPS10-204ENST00000467531 777 ntTSL 211.04□□□□□ -0.645e-7■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 RPS10-201ENST00000326199 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.745e-7■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 PUS7-201ENST00000356362 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.771e-6■□□□□ 10.9
ILF3Q12906 RPS10-202ENST00000344700 650 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.85e-7■□□□□ 10.9
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