Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL9Q07325 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms