Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms