Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
FGD1P98174 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD1P98174 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms