Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ1P61923 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms