Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLTPP55058 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLTPP55058 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLTPP55058 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLTPP55058 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms