Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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