Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms