Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB1P16220 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB1P16220 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB1P16220 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms