Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms