Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms