Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01734 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01734 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01734 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01734 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01734 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01734 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01734 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01734 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01734 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms