Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms