Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms