Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms