Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms