Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms