Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms